Mohamed Ibrahim scored the opening goal from a penalty shortly before half time as the Whites had to wait until the 83rd minute to find the net again.
It was summer signing Momen Zakaria who scored a goal that could prove vital when both sides re-clash in the second leg.
Zakaria's goal relieved more than 10000 supporters at Cairo Stadium, which hosted a continental game for Zamalek for the first time in years.
The retrun game takes place after two weeks in Niamey.
Should Zamalek win, they will meet the winner of the tie between Angola's Kabuscorp and Cote d'Or of Seychelles later this month.
VIDEO HIGHLIGHTS
Ibrahim scores from the spot after youngster Mostafa Fathi was tackled in the box.
Zakaria scores the second after a fine assist by Ahmed Gaafar.
نرشح لكم
أهلا بالفدائي.. غزل المحلة يضم جناح فلسطيني في صفقة انتقال حر
بمشاركة نجوم الكرة.. انطلاق النسخة الثالثة من "Football Access Summit"
عباس قابيل حكما لمباراة كهرباء الإسماعيلية والزمالك
مصطفى شلبي: تدربنا على هدفي في الأهلي.. واحتفالي لجمهور الزمالك
مدرب البنك: نجحنا في استغلال إرهاق الأهلي
البلعوطي: التعادل أمام الأهلي خطوة للتواجد ضمن السبعة الأوائل
مؤتمر الرمادي: غير صحيح أن توروب سهّل المباراة علينا.. وهدفنا أول 7 مراكز
لتراكم الإنذارات.. أحمد عيد يغيب عن الأهلي أمام الإسماعيلي












برشلونة ينجو من مفاجآت الكأس ويهزم قاهر ريال مدريد