The court overruled their initial order to the National Sports Council (NSC) to sack Zaher, who was allegedly ineligible to run for the post in 2008 due to criminal record.
The NSC is expected to issue the reappointment decision soon.
Egypt won the African Cup of Nations three times in a row in 2006, 2008 and 2010 during Zaher's two spells at the helm.
He was also praised for generating income for Egyptian clubs through selling the league's broadcasting rights to several TV networks.
However, critics sharpened the knives for him during the past year after many disputes erupted in domestic football.
Zaher would have stepped down as the EFA president anyway in 2011 because regulations would not have allowed him to remain in his post for a third successive stint.
نرشح لكم
بيزيرا: الزمالك لم يلتزم بوعده معي.. وكنت سأصبح أغلى صفقة في تاريخ النادي
مران الزمالك - تدريبات بدنية وتأهيلية تحضيرا للموسم الجديد
حسين السيد: سيتم تطبيق لائحة العقوبات دون استثناء.. ولا يمكن ضغط أو ليّ ذراع الزمالك
قرعة دوري أبطال إفريقيا - جيبوتي وكينيا.. تحديد طريقي الزمالك وبيراميدز إلى المجموعات
قائمة الأهلي - الصفقات الجديدة وكباكا ضمن معسكر إسبانيا.. وبقرار يلحق بالبعثة
قرعة الكونفدرالية - تحديد منافسي الأهلي المحتملين.. وزد ضد ممثل جيبوتي
انتهت - قرعة الكونفدرالية ودوري أبطال إفريقيا
بعثة الأهلي تطير إلى إسبانيا لخوض معسكر الإعداد ومواجهة برشلونة











