The dispute was triggered when Refaat slapped Emam last week, before the latter backed down on his complaint against the Zamalek icon.
However, Refaat was caught making an inappropriate comment about the 22-year-old midfielder and his wife on a live show on Dream TV when he thought he was off record.
The fresh setback forced Emam to seek legal action against Refaat, who was eventually sacked after just one month in charge.
The former Syria manager was relieved of his duties shortly before informing FilGoal.com of his willingness to resign.
"I intend to remove any discomfort within the club's board in the recent period," Refaat told FilGoal.com on Monday.
"I've been put under a lot of pressure recently because of the Emam crisis, which was mainly caused by Dream TV."
Refaat, a former manager of Zamalek, has been appointed in September as a new board, led by Galal Ibrahim, took charge of the Cairo club.
نرشح لكم
"قرار لا رجعة فيه".. حسين لبيب يعلن عدم ترشحه لرئاسة الزمالك في الانتخابات المقبلة
حسين لبيب: لا بيع لنادي الزمالك و9 شروط للمستثمرين في شركة الكرة
حسين لبيب: تجربة جون إدوارد خطوة أولى نحو شركة الكرة.. ونريد الريادة إداريا
على الأكثر تتويجا.. نهائي بين صنداونز والجيش الملكي في دوري أبطال إفريقيا للسيدات
مؤتمر صحفي لعلي ماهر وكريم حافظ قبل مواجهة مالاوي
إبراهيم صلاح يقود التدريبات.. مشاركة عواد وصبحي في مران الزمالك
مدرب المغرب الفاسي السابق: رحيل بنجديدة أكبر انتكاسة للفريق
منافس بيراميدز - تقرير: عقبة قانونية تؤجل قيادة أمين كرمة لـ المغرب الفاسي










Refaat sacked after inappropriate Emam remark